MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB5

Total Repeats: 2575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009930	TA	3	6	1339	1344	50 %	50 %	0 %	0 %	158340919
2	NC_009930	AAT	2	6	1395	1400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
3	NC_009930	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
4	NC_009930	G	6	6	1604	1609	0 %	0 %	100 %	0 %	158340919
5	NC_009930	AGT	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
6	NC_009930	AAT	2	6	1695	1700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
7	NC_009930	AGACA	2	10	1763	1772	60 %	0 %	20 %	20 %	158340919
8	NC_009930	T	6	6	1792	1797	0 %	100 %	0 %	0 %	158340919
9	NC_009930	CAA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340919
10	NC_009930	TTCA	2	8	1859	1866	25 %	50 %	0 %	25 %	158340919
11	NC_009930	ATA	2	6	1976	1981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
12	NC_009930	GAT	2	6	1993	1998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
13	NC_009930	CCA	2	6	1999	2004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340919
14	NC_009930	ATT	2	6	2026	2031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
15	NC_009930	T	6	6	2064	2069	0 %	100 %	0 %	0 %	158340919
16	NC_009930	CCGA	2	8	2072	2079	25 %	0 %	25 %	50 %	158340919
17	NC_009930	TTC	2	6	2093	2098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340919
18	NC_009930	ATT	2	6	2103	2108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
19	NC_009930	GTCT	2	8	2120	2127	0 %	50 %	25 %	25 %	158340919
20	NC_009930	ATA	2	6	2201	2206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
21	NC_009930	AGAC	2	8	2209	2216	50 %	0 %	25 %	25 %	158340919
22	NC_009930	TGA	2	6	2217	2222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
23	NC_009930	ATAA	2	8	2236	2243	75 %	25 %	0 %	0 %	158340919
24	NC_009930	TCA	2	6	2257	2262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340919
25	NC_009930	ATTA	2	8	2394	2401	50 %	50 %	0 %	0 %	158340919
26	NC_009930	TTATC	2	10	2539	2548	20 %	60 %	0 %	20 %	158340919
27	NC_009930	TTC	2	6	2555	2560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340919
28	NC_009930	GAT	2	6	2590	2595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
29	NC_009930	GAT	2	6	2623	2628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340919
30	NC_009930	AAG	2	6	2676	2681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340919
31	NC_009930	AGA	2	6	2730	2735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340919
32	NC_009930	TC	3	6	2762	2767	0 %	50 %	0 %	50 %	158340919
33	NC_009930	CT	3	6	2846	2851	0 %	50 %	0 %	50 %	158340919
34	NC_009930	ATTT	2	8	2864	2871	25 %	75 %	0 %	0 %	158340919
35	NC_009930	TAC	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340919
36	NC_009930	AGC	2	6	2880	2885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340919
37	NC_009930	AAG	2	6	2933	2938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340919
38	NC_009930	TCA	2	6	2962	2967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340919
39	NC_009930	TGG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340919
40	NC_009930	TTC	2	6	3010	3015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340919
41	NC_009930	ATT	2	6	3027	3032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
42	NC_009930	ATT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340919
43	NC_009930	TGGT	2	8	3159	3166	0 %	50 %	50 %	0 %	158340919
44	NC_009930	AATG	2	8	3169	3176	50 %	25 %	25 %	0 %	158340919
45	NC_009930	GA	3	6	3228	3233	50 %	0 %	50 %	0 %	158340919
46	NC_009930	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
47	NC_009930	ATA	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340919
48	NC_009930	A	6	6	3545	3550	100 %	0 %	0 %	0 %	158340920
49	NC_009930	CAA	2	6	3569	3574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340920
50	NC_009930	ACT	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340920
51	NC_009930	AGGG	2	8	3779	3786	25 %	0 %	75 %	0 %	158340921
52	NC_009930	GAC	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340921
53	NC_009930	ACCC	2	8	3804	3811	25 %	0 %	0 %	75 %	158340921
54	NC_009930	C	6	6	3895	3900	0 %	0 %	0 %	100 %	158340921
55	NC_009930	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340921
56	NC_009930	TCA	2	6	4052	4057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340921
57	NC_009930	GTTT	2	8	4217	4224	0 %	75 %	25 %	0 %	158340921
58	NC_009930	TTC	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340922
59	NC_009930	AAC	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
60	NC_009930	TCT	2	6	4977	4982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340922
61	NC_009930	AGT	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340922
62	NC_009930	TGG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
63	NC_009930	TAT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
64	NC_009930	AGA	2	6	5235	5240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340922
65	NC_009930	AAC	2	6	5259	5264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
66	NC_009930	AGA	2	6	5282	5287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340922
67	NC_009930	TAAT	2	8	5354	5361	50 %	50 %	0 %	0 %	158340922
68	NC_009930	GTC	2	6	5495	5500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340922
69	NC_009930	AAC	2	6	5532	5537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
70	NC_009930	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
71	NC_009930	TC	3	6	5613	5618	0 %	50 %	0 %	50 %	158340922
72	NC_009930	CAAT	2	8	5638	5645	50 %	25 %	0 %	25 %	158340922
73	NC_009930	TTG	2	6	5657	5662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
74	NC_009930	A	6	6	5704	5709	100 %	0 %	0 %	0 %	158340922
75	NC_009930	TGA	2	6	5751	5756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340922
76	NC_009930	GCAT	2	8	5775	5782	25 %	25 %	25 %	25 %	158340922
77	NC_009930	TGA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340922
78	NC_009930	AATG	2	8	5895	5902	50 %	25 %	25 %	0 %	158340922
79	NC_009930	CAA	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
80	NC_009930	CAA	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
81	NC_009930	T	7	7	5982	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	158340922
82	NC_009930	ATT	2	6	6027	6032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
83	NC_009930	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340922
84	NC_009930	TGC	2	6	6363	6368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340922
85	NC_009930	TAC	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340922
86	NC_009930	ATT	2	6	6427	6432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
87	NC_009930	T	6	6	6565	6570	0 %	100 %	0 %	0 %	158340922
88	NC_009930	GGAT	2	8	6579	6586	25 %	25 %	50 %	0 %	158340922
89	NC_009930	TTA	2	6	6653	6658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
90	NC_009930	GTTT	2	8	6704	6711	0 %	75 %	25 %	0 %	158340922
91	NC_009930	TTG	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
92	NC_009930	GTT	2	6	6769	6774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
93	NC_009930	GATT	2	8	6800	6807	25 %	50 %	25 %	0 %	158340922
94	NC_009930	ATT	2	6	6898	6903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
95	NC_009930	GGT	2	6	6910	6915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
96	NC_009930	GTT	2	6	6925	6930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340922
97	NC_009930	AAC	2	6	6953	6958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340922
98	NC_009930	TGG	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
99	NC_009930	CTG	2	6	7018	7023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340922
100	NC_009930	TGG	2	6	7059	7064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
101	NC_009930	GATTA	2	10	7077	7086	40 %	40 %	20 %	0 %	158340922
102	NC_009930	ACT	2	6	7089	7094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340922
103	NC_009930	TGG	2	6	7095	7100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
104	NC_009930	TGG	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
105	NC_009930	AATG	2	8	7198	7205	50 %	25 %	25 %	0 %	158340922
106	NC_009930	TTA	2	6	7219	7224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340922
107	NC_009930	GGT	2	6	7234	7239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340922
108	NC_009930	CAT	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340923
109	NC_009930	TCGT	2	8	7628	7635	0 %	50 %	25 %	25 %	158340923
110	NC_009930	CGTT	2	8	7648	7655	0 %	50 %	25 %	25 %	158340923
111	NC_009930	CT	3	6	7692	7697	0 %	50 %	0 %	50 %	158340923
112	NC_009930	GACA	2	8	7835	7842	50 %	0 %	25 %	25 %	158340923
113	NC_009930	TGCC	2	8	7902	7909	0 %	25 %	25 %	50 %	158340923
114	NC_009930	CAA	2	6	7934	7939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340923
115	NC_009930	CAG	2	6	7979	7984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340923
116	NC_009930	CAA	2	6	8019	8024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340923
117	NC_009930	CAA	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340923
118	NC_009930	ATC	2	6	8067	8072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340923
119	NC_009930	GTA	2	6	8089	8094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340923
120	NC_009930	CA	3	6	8129	8134	50 %	0 %	0 %	50 %	158340923
121	NC_009930	CCCA	2	8	8158	8165	25 %	0 %	0 %	75 %	158340923
122	NC_009930	CTT	2	6	8173	8178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340923
123	NC_009930	GAAT	2	8	8212	8219	50 %	25 %	25 %	0 %	158340923
124	NC_009930	GTG	2	6	8348	8353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340923
125	NC_009930	GGT	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340923
126	NC_009930	TCG	2	6	8460	8465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340923
127	NC_009930	TCT	2	6	8485	8490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340923
128	NC_009930	AGC	2	6	8541	8546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340923
129	NC_009930	CGC	2	6	8592	8597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340923
130	NC_009930	CGTT	2	8	8616	8623	0 %	50 %	25 %	25 %	158340923
131	NC_009930	AAGA	2	8	8667	8674	75 %	0 %	25 %	0 %	158340923
132	NC_009930	GTT	2	6	8687	8692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340923
133	NC_009930	CCTC	2	8	8698	8705	0 %	25 %	0 %	75 %	158340923
134	NC_009930	AAT	2	6	8738	8743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340923
135	NC_009930	ATG	2	6	8848	8853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340923
136	NC_009930	GCTG	2	8	8884	8891	0 %	25 %	50 %	25 %	158340923
137	NC_009930	CTTT	2	8	8894	8901	0 %	75 %	0 %	25 %	158340923
138	NC_009930	ATCGTG	2	12	8919	8930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158340923
139	NC_009930	TCA	2	6	8947	8952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340923
140	NC_009930	CAA	2	6	9024	9029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340923
141	NC_009930	GCA	2	6	9365	9370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340924
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143	NC_009930	TCC	2	6	9501	9506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340924
144	NC_009930	GAA	2	6	9564	9569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340924
145	NC_009930	TTTC	2	8	9596	9603	0 %	75 %	0 %	25 %	158340924
146	NC_009930	GAG	2	6	9671	9676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340924
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151	NC_009930	TTC	2	6	10019	10024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340925
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157	NC_009930	CCG	2	6	10378	10383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340925
158	NC_009930	AG	3	6	10529	10534	50 %	0 %	50 %	0 %	158340925
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162	NC_009930	AAG	2	6	11278	11283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340927
163	NC_009930	GAT	2	6	11331	11336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340927
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165	NC_009930	ATT	2	6	11396	11401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340927
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179	NC_009930	TTC	2	6	11981	11986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340928
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183	NC_009930	AT	3	6	12110	12115	50 %	50 %	0 %	0 %	158340929
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264	NC_009930	GAT	2	6	18582	18587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340939
265	NC_009930	TCA	2	6	18662	18667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340939
266	NC_009930	GTT	2	6	18732	18737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340939
267	NC_009930	TTC	2	6	18831	18836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340940
268	NC_009930	ATT	2	6	18862	18867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340940
269	NC_009930	CCA	2	6	18922	18927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340940
270	NC_009930	TAAT	2	8	18959	18966	50 %	50 %	0 %	0 %	158340940
271	NC_009930	GA	3	6	18994	18999	50 %	0 %	50 %	0 %	158340940
272	NC_009930	GGA	2	6	19156	19161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340940
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283	NC_009930	ATA	3	9	19520	19528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340940
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295	NC_009930	TAT	2	6	21159	21164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340943
296	NC_009930	AT	3	6	21163	21168	50 %	50 %	0 %	0 %	158340943
297	NC_009930	T	6	6	21197	21202	0 %	100 %	0 %	0 %	158340943
298	NC_009930	TCT	2	6	21239	21244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340943
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302	NC_009930	TGA	2	6	21326	21331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340943
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392	NC_009930	ACA	2	6	27093	27098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340950
393	NC_009930	CCT	2	6	27108	27113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340950
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500	NC_009930	ATTTGA	2	12	33155	33166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158340956

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